跑步小腹疼可能是肠痉挛、阑尾炎导致的，也可能是结肠炎的原因，建议在医生的指导下应用药物治疗。

1、肠痉挛：

肠痉挛通常是由于饮食不当、局部受凉等原因导致，患病后患者会出现发热、呕吐等症状，还会出现跑步小腹疼的情况，建议在医生的指导下应用药物治疗，比如硫酸阿托品注射液、苯巴比妥片、维U颠茄铝胶囊等。

2、阑尾炎：

阑尾炎通常是阑尾管腔阻塞、细菌感染等因素所导致，患病后患者会出现恶心、呕吐等症状，还会出现跑步小腹疼的现象，建议在医生指导下应用药物治疗，比如甲硝唑片、替硝唑片、盐酸莫西沙星片等。

3、结肠炎：

结肠炎通常是由于遗传、免疫失衡等因素所导致，患病后患者会出现腹泻、发热等症状，还会出现跑步小腹疼的情况，建议在医生的指导下应用药物治疗，比如美沙拉嗪肠溶片、奥沙拉秦钠胶囊、甲泼尼龙片等。

除以上疾病外，还可能是盆腔炎、附件炎等原因导致，建议严格遵医嘱应用药物，避免擅自增加药物的剂量。