跑完步耳朵胀疼可能是由于外耳道疖肿、中耳炎、鼓膜炎等原因引起的，可以通过药物和物理治疗。

1、外耳道疖肿：

主要表现为耳痛，可放射至同侧头部，运动时疼痛可加重，所以会出现跑完步耳朵胀疼的现象，早期疖肿不成熟时可进行局部热敷、红外线照射等物理疗法，或将鱼石脂软膏置于疖肿处缓解疼痛。

2、中耳炎：

可表现为耳部剧烈疼痛，有耳内闷堵感，剧烈运动时疼痛加重，所以出现上述现象是中耳炎导致。一般需要应用抗生素如头孢克肟、阿莫西林、头孢呋辛酯等来预防感染，如果鼓膜没有穿孔，可以使用苯酚甘油滴耳液，起到消炎止痛的作用。鼓膜穿孔时应用过氧化氢洗耳，再用氧氟沙星滴耳液，通常就可以缓解此症状了。

3、鼓膜炎：

一般表现为耳痛、耳鸣、听力下降，剧烈运动后血液循环加速，导致耳内充血肿胀，使胀疼感加剧，一般数日后可自愈。

除此之外，患者如果患有鼻窦炎、牙周炎、扁桃体炎等疾病，也会导致此症状的，建议患者及时就诊治疗。