男性生殖器皮肤上长了很多小疙瘩不疼不痒的通常是因为毛囊炎、寻常疣、皮肤纤维瘤等疾病导致，需要进行药物治疗以及物理治疗。

1、毛囊炎：毛囊炎通常是因为患者平时不注意局部的清洁工作引起，会导致患者出现毛囊瘙痒、皮肤肿胀等症状，如果患者的症状比较轻，也不会出现疼痛以及瘙痒的情况，从而造成局部长了好多小红点不疼不痒，一般需要通过涂抹莫匹罗星软膏、红霉素软膏等药物进行治疗。

2、寻常疣：寻常疣通常是因为感染了人乳头瘤病毒引起，与患者平时不良的性生活有很大关系，通常会导致患者出现皮肤粗糙、皮肤微微隆起等症状，如果患者的症状比较轻，一般不会出现疼痛以及瘙痒的情况，一般需要通过激光手术的方式进行治疗。

3、皮肤纤维瘤：皮肤纤维瘤通常是因为局部经常损伤引起，也有可能是因为感染的病毒等因素导致，皮肤纤维瘤会使患者出现局部疼痛、皮肤隆起等症状，如果患者的病情比较轻，也不会出现疼痛的现象，一般需要通过外科手术的方式将局部肿瘤切除。

除了以上原因以外，还有可能是荨麻疹等原因引起，不管是哪种疾病，都需要积极治疗。