睡着了突然咳嗽呛醒了可能是感冒、喉炎、咽炎等原因引起的，可以通过局部用药、口服药物、静脉滴注等方法治疗。

1、感冒：感冒是一种比较常见的呼吸系统疾病，容易导致患者出现咳嗽、发热等症状，咳嗽的过程中会产生唾液，容易呛醒，可以遵医嘱服用四季感冒片、感冒灵颗粒、复方氨酚烷胺胶囊等药物治疗。

2、喉炎：喉炎主要发生在喉部黏膜，可能是病原微生物感染引起的，患者可能会出现声音嘶哑、咳嗽、鼻塞等症状，可以选择静脉滴注的方法治疗，常用的药物一般有氯化钠注射液、注射用头孢拉定、阿奇霉素注射液等。

3、咽炎：咽炎发病原因比较复杂，可能是身体免疫力低下的原因，也可以考虑是长期接触刺激性的物质引起的，患者会出现咽痛、咽部有异物感，会刺激唾液腺分泌过多的唾液，患者在睡觉时如果咳嗽可能会被呛醒，可以在医生的指导下服用咽炎片、阿莫西林胶囊、头孢拉定胶囊等药物治疗。

除了上述原因和治疗方法以外，也可以考虑是支气管炎的原因，还可以通过肌肉注射的方法治疗，治疗期间要保持良好的生活习惯，对病情恢复有一定作用。